2. Anal fissürlerin önemli bir kısmı ameliyat gerekmeden ilaçla tedavi edilebilir. İlaçla tedavi edilemeyen hastalar ameliyat edilir. Ameliyatta görevi dışkı kontrolünü sağlamak olan kaslar belli bir ölçüde kesilerek gevşetililir. Burada kesilecek kas miktarı son derece önemlidir. Eğer gereğinden az kas kesilirse hasta iyileşmez. Yakınmaları devam eder. Gerektiğinden fazla kas kesilirse bu sefer dışkı kontrolü bozuklukları ( inkontinans) oluşabilir. Hasta gazını tutamayabilir veya zaman zaman büyük abdestini kaçırır.